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月月桂AACT基因的cDNA全长克隆及生物信息学分析

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成果类型:
期刊论文
作者:
郑玉娟;周文化;张党权;陈丽莉;陈容;...
作者机构:
[陈丽莉; 陈容; 张党权; 郑玉娟] 中南林业科技大学
[周文化] 稻谷及副产物深加工国家工程实验室
[龚建平] 湖南澧县树大园林有限公司
语种:
中文
关键词:
月月桂;乙酰辅酶A酰基转移酶;全长cDNA克隆;生物信息学分析
关键词(英文):
CDNA;Aeetyl-CoA C-acetyltransferase;full length cDNA cloning;bioinformaties analysis
期刊:
中南林业科技大学学报
ISSN:
1673-923X
年:
2015
卷:
35
期:
6
页码:
87-92
基金类别:
国家林业公益性行业科研专项(201204610) 湖南省科技计划重点项目(2014FJ2004) 湖南省教育厅一般项目(13C1168)
机构署名:
本校为第一机构
院系归属:
林学院
摘要:
为了克隆分离月月桂AACT(乙酰辅酶A酰基转移酶)全长基因,并研究其基因特征和蛋白结构,以月月桂花瓣RNA为模板,通过反转录PCR及RACCE技术分离克隆AACT全长。再利用NCBI网站及生物信息学软件对其碱基分布、氨基酸组成、亲疏水性、二级结构、保守区及三级结构进行预测和分析,并对10个物种的AACT氨基酸进行多重比对,对基因进行进化分析。分离克隆出AACT基因的cDNA序列长为1580bp,编码405个氨基酸,该蛋白质相对分子质量为41347.89D,等电点为5.66,其中Ala含量最高为14.53%,平均疏水值为0.215,属Cond-enzymes超家族。氨基酸序列比对中,胡黄连、假马齿苋氨基酸序列同源性最高。 OsAACT基因稳定,编码的蛋...
摘要(英文):
In order to clone and separate the gene of AACT in Osmanthusfrangtans, and to study its genetic characteristics and protein structure, by taking RNA in O. frangrans flower as template, AACT gene was isolated from flowers of O. frangrans by the method of reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR) and the rapid amplification of eDNA ends(RACE) technique. NCBI website and bio-informaties sottware were used to predict and analyze base distribution, amino acids composition, hydrophilicity or hydrophobicity, hyper-conservative regio...

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