本发明公开了一种结合树顶树干检测与林木模型的机载点云分割方法,具体包括以下步骤:对原始机载点云数据进行预处理,获取目标点云,并生成冠层高度模型;利用冠层高度模型,获取树顶位置;基于目标点云,获取树干位置;将树顶位置和树干位置进行匹配,获取树顶点与树干点的合并点集;利用树顶点与树干点的合并点集,重构合并点集中未匹配的树干点,获取重构后的合并点集;通过林木模型和重构后的合并点集,完成结合树顶树干检测与林木模型的机载点云分割。本发明能够有效处理具有复杂冠层结构的林分,对遮挡木有良好的探测能力,且在不同林分密度下具有优异的鲁棒性。