用ISSR分子标记对13个砂梨品种进行了遗传多样性分析,从50条ISSR引物中筛选出多态性好、稳定性高的12条引物对13个梨品种的DNA序列进行了PCR扩增,共扩增出92个位点,多态性位点比率为63.04%;建立了13个砂梨品种的分子识别卡,用2条引物的9个多态性位点即可将13砂梨品种分开来;采用UPGMA聚类方法构建了各品种之间的聚类图,结果显示,新世纪梨作亲本的品种与非新世界梨做亲本的品种间可明显划分为2组,可进一步细分为6个亚组。本研究为砂梨品种之间的杂交实验和梨新品种培育以及新世纪梨为原料加工产品的真伪鉴别提供了可靠的理论依据。