版权说明 操作指南
首页 > 成果 > 成果详情

基于20种桉树叶绿体matK基因序列的系统发育分析

认领
导出
下载 Link by 中国知网学术期刊 Link by 维普学术期刊 Link by 万方学术期刊
反馈
分享
QQ微信 微博
成果类型:
期刊论文
作者:
刘果;谢耀坚;张党权;罗建中;曾艳飞
作者机构:
[谢耀坚; 刘果; 罗建中] 国家林业局桉树研究开发中心
中南林业科技大学林业生物技术湖南省重点实验室经济林育种与栽培国家林业局重点实验室经济林培育与保护省部共建教育部重点实验室
中国林业科学研究院林业研究所国家林业局林木培育重点实验室
[曾艳飞] 中国林业科学研究院林业研究所
[张党权] 中南林业科技大学
语种:
中文
关键词:
桉树;叶绿体;matK基因;系统发育分析
关键词(英文):
Eucalyptus;chloroplast;matK gene;phylogenetic analysis
期刊:
桉树科技
ISSN:
1674-3172
年:
2014
期:
3
页码:
1-9
基金类别:
“十二五”农村领域国家科技计划课题“白桦、桉树等分子育种与品种创制”(2011AA100202);
机构署名:
本校为第一机构
院系归属:
林学院
生命科学与技术学院
摘要:
随着公共数据库信息量的不断丰富,桉树基因组序列的公布数据也逐渐增多。本文利用NCBI数据库下载的21条桉树叶绿体matK基因序列进行分析研究,发现软件构建的系统发育树树与学术界承认和使用的Hill & Johnson形态分类学状态有一定的差异,可能与下载的序列数据不够全面、覆盖的信息量不能代表该种基因组序列有关。通过对MP法、ML法、NJ法、UPGMA法和Bayes法等5种方法构建系统发育树、序列信息位点分析和形态学分类状态的比较,UPGMA 法构建的系统发育树与序列的信息位点分析结果较为一致,MP 法构建的系统发育树较为可信,但进一步的信息确认还需后续的研究证实。
摘要(英文):
With the enrichment of public databases, the release of Eucalyptus genome sequence data has gradually been increasing. In this study, 21 Eucalyptus chloroplast matK gene sequences were downloaded from the NCBI database for analytical use. Depending on the software used, we found the phylogenetic trees obtained could differ from the morphological taxonomic status according to Hill Johnson, which is accepted as the academic standard. These differences might relate to the sequence data not being comprehensive, as the amount of information obtained...

反馈

验证码:
看不清楚,换一个
确定
取消

成果认领

标题:
用户 作者 通讯作者
请选择
请选择
确定
取消

提示

该栏目需要登录且有访问权限才可以访问

如果您有访问权限,请直接 登录访问

如果您没有访问权限,请联系管理员申请开通

管理员联系邮箱:yun@hnwdkj.com