根据油桐转录组酸性磷酸酶蛋白全长序列设计引物,通过RT-PCR直接扩增的方法从油桐种子中克隆到了酸性磷酸酶基因.对该cDNA序列、核苷酸序列的相似性、理化性质、疏水性、二级结构、三级结构及是否跨膜进行了分析预测,进行了多序列比对并构建了系统树.结果表明:油桐ACPase开放阅读框为1152bp,编码384个氨基酸残基,相对分子质量为40.94kDa,理论PI为5.30,属可溶性蛋白.二级结构主要由不规则卷曲、α-螺旋和β-折叠构成.同源性和进化树的预测分析显示,油桐ACPase蛋白与蓖麻的酸性磷酸酶蛋白同源性达到了78.9%,两者均属大戟科.该结果为进一步分析油桐ACPase的功能奠定了基础。