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油桐ACPase基因的克隆及生物信息学分析

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成果类型:
会议论文
作者:
周俊琴;谭晓风;袁军;刘美兰
作者机构:
中南林业科技大学 经济林培育与保护教育部重点实验室,湖南 长沙 410004
语种:
中文
关键词:
油桐;酸性磷酸酶;基因克隆;生物信息学
年:
2013
页码:
1-5
会议名称:
第三届中国林业学术大会
会议论文集名称:
第三届中国林业学术大会论文集
会议时间:
2013-09-01
会议地点:
福州
会议赞助商:
中国林学会<&wdkj&>国家林业局<&wdkj&>福建省人民政府
机构署名:
本校为第一机构
院系归属:
林学院
摘要:
根据油桐转录组酸性磷酸酶蛋白全长序列设计引物,通过RT-PCR直接扩增的方法从油桐种子中克隆到了酸性磷酸酶基因.对该cDNA序列、核苷酸序列的相似性、理化性质、疏水性、二级结构、三级结构及是否跨膜进行了分析预测,进行了多序列比对并构建了系统树.结果表明:油桐ACPase开放阅读框为1152bp,编码384个氨基酸残基,相对分子质量为40.94kDa,理论PI为5.30,属可溶性蛋白.二级结构主要由不规则卷曲、α-螺旋和β-折叠构成.同源性和进化树的预测分析显示,油桐ACPase蛋白与蓖麻的酸性磷酸酶蛋白同源性达到了78.9%,两者均属大戟科.该结果为进一步分析油桐ACPase的功能奠定了基础。

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