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果生刺盘孢菌Colletotrichum fructicola群体遗传结构研究

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成果类型:
期刊论文
作者:
朱丹雪;周国英;徐建平;刘君昂;李河
作者机构:
[朱丹雪] 中南林业科技大学经济林培育与保护教育部重点实验室 湖南长沙410004
[朱丹雪] 中南林业科技大学生命科学与技术学院 湖南长沙410004
[刘君昂; 徐建平; 周国英; 李河] 中南林业科技大学
语种:
中文
关键词:
油茶炭疽病;ITS-5.8S序列;种群遗传结构
关键词(英文):
Colletotrichum fructicola
期刊:
菌物学报
ISSN:
1672-6472
年:
2015
卷:
34
期:
3
页码:
366-374
基金类别:
国家自然科学基金(31100479);
机构署名:
本校为第一机构
院系归属:
林学院
生命科学与技术学院
摘要:
研究了10个不同地区Colletotrichum fructicola菌株群体遗传结构。145个病菌样品ITS序列可推导出13种单倍体型(haplotype),其中,Haplotype 5为优势单倍型,有127个菌株。湖北随州地理种群与其他种群遗传分化极大,遗传分化指数(F_(ST))为0.14685-0.40385。AMOVA分析显示,种群间和种群内的遗传变异分别占总变异的13%和87%;Mantel测试显示地理距离与遗传分化没有显著的线性关系;该菌经历过种群扩张,群体间存在有效基因流。
摘要(英文):
nrDNA ITS sequences were used to analyze the genetic structure and genetic diversity of Colletotrichum fructicola populations consisting of 145 strains isolated from 10 sites. A total of 13 ITS haplotypes were identified among which the dominant haplotype (haplotype 5) included 127 specimens from the 10 sites. The genetic differentiation index, FST, revealed significant genetic differentiation between Suizhou populations and the others. AMOVA test showed that 13% of genetic differentiation occurred among population and 87% within population. ...

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