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油桐β-酮脂酰-ACP还原酶(KAR)基因的克隆与序列分析

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成果类型:
期刊论文
作者:
刘美兰;谭晓风;龙洪旭;张琳;周俊琴;...
作者机构:
[刘美兰; 周俊琴; 龙洪旭; 王建勇; 张琳; 谭晓风] 中南林业科技大学
语种:
中文
关键词:
油桐;β-酮脂酰-ACP还原酶;生物信息学
关键词(英文):
Vf_KAR1;Vf_KAR2
期刊:
江西农业大学学报
ISSN:
1000-2286
年:
2013
卷:
35
期:
5
页码:
962-969
基金类别:
国家林业公益性行业科研专题(200904023); 国家林业公益性行业科研专项重点项目(201204403);
机构署名:
本校为第一机构
院系归属:
林学院
摘要:
以葡萄桐近成熟种子为材料,根据油桐转录组测序分析结果设计引物,利用RT-PCR技术克隆获得了2条KAR基因的全长cDNA,分别命名为Vf_KAR1和Vf _KAR2(GenBank登录号:KF025646,KF025647).生物信息学分析结果表明,Vf_KAR1和Vf_KAR2基因的CDS长度分别为993 bp和900 bp,分别编码331个和300个氨基酸;与其它物种的KAR氨基酸序列具有较高的相似性,Vf_KAR1与蓖麻的相似度最高,达82%;Vf_KAR2基因与花生、辣椒的相似度高达76%;2条KAR基因的多肽都含叶绿体转运肽,但是都没有信号肽;Vf_KAR1有1个明显的跨膜螺旋拓扑结构和1个疑似跨膜螺旋拓扑结构,Vf_KAR2有2个疑似的跨膜螺旋拓扑结构;肽链都表现为疏水性,都有典...
摘要(英文):
Primers were designed according to the results of the transcriptome sequencing analysis of Vernicia fordii,two full-lengths KAR cDNA were cloned by RT-PCR technique from nearly ripe seed in Vernicia fordii,which were respectively named Vf_KAR1 and Vf_KAR2 (GenBank accession number:KF025646,KF025647).The bioinformatics analysis showed that the CDS lengths of Vf_KAR1 and Vf_KAR2 genes were 993 bp and 900 bp respectively,coding 331 and 300 amino acids;the two sequences had high similarity with other species,Vf_KAR1 had the highest similarity wi...

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