期刊论文

Gene expression and phylogenetic analysis of MADS-box family genes in Ginkgo biloba

Wang, Y.-Q.

中文

植物生理与分子生物学学报

1671-3877

2018

54

6

1055-1063

10.13592/j.cnki.ppj.2017.0574

国家自然科学基金（31570682） 国家重点研发计划（2017YFD0600701）

本校为第一且通讯机构

MADS-box基因是真核生物中一类编码转录调控因子的基因家族,在植物花器官发育中发挥重要的调控作用。为了探究MADS-box家族基因在银杏花发育中的功能,本文对银杏花芽分化4个时期的样品进行转录组测序,筛选其中的MADS-box家族基因,利用生物信息学方法对筛选到的基因进行表达模式、蛋白结构、细胞定位和系统进化分析。结果显示:共得到15个银杏MADS-box家族基因。表达分析表明,目标基因根据表达模式可以分为3种类型。分析目标基因的编码序列显示,15个银杏MADS-box蛋白的主要构件均为α-螺旋和无规则卷曲;亚细胞定位预测主要在细胞核内;所有表达产物均包含MADS结构域。聚类分析显示,银杏MADSbox基因...

The MADS-box gene is a family of genes that encode transcriptional regulators in eukaryotes and plays an important regulatory role in floral development. In order to study the function of MADS-box gene in G. biloba, We sequenced the transcriptome of G. biloba, including four stages of flower bud differentiation, and screened the MADS-box family of G. biloba. Expression pattern, sequence signature, subcellular location and phylogenetic analysis were analyzed by the bioinformatics methods. The results showed that, 15 G. biloba MADS-box family gen...