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油桐VfFATB1基因的克隆及其功能的初步分析

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成果类型:
期刊论文
作者:
刘美兰;龙洪旭;谭晓风
通讯作者:
Tan, X.-F.
作者机构:
[刘美兰; 龙洪旭; 谭晓风] 中南林业科技大学, 经济林培育与保护湖南省部共建教育部重点实验室, 长沙, 410004
通讯机构:
Key Laboratory of Cultivation and Protection for Non-Wood Forest Trees, Ministry of Education, Central South University of Forestry and Technology, Changsha, China
语种:
中文
关键词:
油桐;脂肪酸生物合成;生物信息学;表达模式;亚细胞定位
关键词(英文):
FATB1
期刊:
植物生理与分子生物学学报
ISSN:
1671-3877
年:
2016
卷:
52
期:
6
页码:
895-904
基金类别:
This work was supported by National Forestry Public Welfare Industry Research Project of China 资助国家林业公益性行业科研专项重点项目
机构署名:
本校为第一且通讯机构
院系归属:
林学院
摘要:
以油桐转录组数据中FATB1基因的cDNA片段为模板, 通过RACE技术克隆获得该基因的CDS, 命名为VfFATB1, 并进行了生物信息学分析, 同时通过Real-time PCR和亚细胞定位对该基因的表达模式和表达部位进行了研究分析。结果表明VfFATB1是一个由8个α-螺旋和10个β-折叠组成“hot-dog”折叠结构的二聚体, 与JcFATB1相似度高达92%; 该基因有FAT重要催化作用的半胱氨酸活性位点Cys 320和3个保守的组氨酸位点His 140/285/345; 该基因在油脂合成后期种仁中的表达量最高, 是幼根的30倍左右, 且在油脂合成过程中一直是上调状态; 该基因定位于叶绿体中。综上所述, VfFATB1是一个位于叶绿体中且含有多个催化功能...
摘要(英文):
In this research, we report the cloning and functional analysis of VfFATB1 in tung tree (Vernicia fordii) that shares high similarity with Jatropha curcasto FATB1 (fatty acyl-ACP thioesterase B1) gene, up to 92%. The encoded protein contains a typical domain of "hot dog" folds composed 8 α-helixes and 10 β-sheets. It also has one essential Cys320 residue and three conserved His140/285/345 of FAT catalytic sites. At the same time, it has highest expression in the seed kernel, about 30 times than radicle, and was significantly increased during ...

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