转录组测序揭示油桐脂肪酸的合成途径

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成果类型：

期刊论文

作者：

陈昊;蒋桂雄;龙洪旭;谭晓风

通讯作者：

Tan, X.-F.

作者机构：

The Key Laboratory of Cultivation and Protection for Non-wood Forest Trees, Ministry of Education, Central South University of Forestry and Technology, Changsha 410004, China

The Key Laboratory of Nonwood Forest Products of State Forestry Administration, Central South University of Forestry and Technology, Changsha 410004, China

通讯机构：

The Key Laboratory of Cultivation and Protection for Non-wood Forest Trees, Ministry of Education, Central South University of Forestry and Technology, China

语种：

中文

关键词：

油桐(Vernicia fordii);转录组;脂肪酸生物合成;表达模式

关键词(英文)：

Expression profiles;Fatty acid biosynthesis;RNA-Seq;Transcriptome;Tung oil tree (Vernicia fordii)

期刊：

植物生理与分子生物学学报

ISSN：

1671-3877

年：

2014

卷：

期：

页码：

37-44

基金类别：

国家林业公益性行业科研专项重大项目

机构署名：

本校为第一且通讯机构

院系归属：

林学院

摘要：

油桐是我国重要的木本油料植物,过去对油桐的研究主要集中于栽培和常规育种,与油桐种仁油脂合成相关的分子机理研究还未见报道。本研究采用转录组测序(RNA-Seq)技术,比较了油桐种子油脂合成3个不同时期的转录组,获得了大量差异表达的Unigene序列。通过GO (Gene Ontology)分类和代谢途径富集性分析将这些差异表达的Unigene归类于包含脂肪酸生物合成途径在内的128个代谢途径。随后将脂肪酸生物合成途径中的54个Unigene序列在KEGG (Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)数据库中进行比对,获得了14个关键酶的同源蛋白质。本研究通过对编码这些同源蛋白质的基因在油桐种子油脂合成期的表达模式进...

摘要(英文)：

Tung oil tree (Vernicia fordii) is one of the important woody oil plants in China. Past researches on tung oil tree are mainly focused on the cultivation and conventional breeding while the molecular mechanisms related to tung oil synthesis are still uncovered. This research compared transcriptome of seeds of tung oil tree at three different oil synthesis stages using transcriptome sequencing (RNA-Seq) technology and then obtained a lot of differentially expressed Unigenes. Through Gene Ontology (GO) classification and pathway enrichment analysis, all of these differentially expressed Unigenes...

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