会议论文

Isolation and Bioinformatics Analysis of CoPht1; 2 from Oil Tea

中文

2012

1-7

中国林学会经济林分会2012年学术年会

中国林学会经济林分会2012年学术年会论文集

2012-11-01

浙江临安

中国林学会

本校为第一机构

　　以油茶品种‘ 华硕’为试材,通过 RT-PCR 和 RACE 的方法克隆出油茶磷酸转运子Pht1 基因家族一个成员的全长cDNA序列,命名为CoPht1；2(GenBank 登录号：JX412956.1),通过生物信息学技术对其序列的理化性质、结构与功能进行分析和预测.结果表明：CoPht1；2 CDS 长度为1 590 bp,编码530个氨基酸,与其它物种的Pht1 氨基酸序列具有较高的相似性,其中与杨柳科毛果杨的 Pht1相似性最高,达到 77.5％；该基因所编码蛋白质的分子量为58.02 kD,理论等电点pI 为8.97,二级结构主要由α-螺旋、β-折叠和不规则卷曲构成,包含12个明显的跨膜螺旋拓扑结构；预测显示该蛋白是一个疏水跨膜蛋白,具有磷转运蛋白...

　　The phosphate transporter named CoPht1;2 was isolated from oil tea(Camellia oleifera’Huashuo’)with the method of RT-PCR and RACE.Bioinformatics approach was used to analyze and predict the function and domain of CoPht1; 2.The CDS of CoPht1; 2 is 1 590 bp in length and it codes a predicted protein of 530 amino acids.The amino acid identity compared with other phosphate transporters is highly conserved and showed the highest similarity(77.5%)with the CoPht1;1 of populus trichocarpa.The estimated molecular weight and isoelectric point of the...