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梨自交不亲和基因cDNA芯片杂交条件优化及应用

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成果类型:
期刊论文
作者:
谭慧;谭晓风;江南;邓靖;王楚正
作者机构:
中南林业科技大学经济林培育与保护省部共建教育部重点实验室/经济林育种与栽培国家林业局重点实验室,湖南长沙,410004
中南林业科技大学经济林培育与保护省部共建教育部重点实验室/经济林育种与栽培国家林业局重点实验室,湖南长沙410004
湖南工业大学包装与材料工程学院/生命科学与化学学院,湖南株洲412007
湖南工业大学包装与材料工程学院/生命科学与化学学院,湖南株洲,412007
[江南; 谭慧; 王楚正; 谭晓风] 中南林业科技大学
语种:
中文
关键词:
梨;cDNA芯片;S-RNase基因;杂交;S基因型
关键词(英文):
cDNA microarray;S-RNase;hybridization;S-genetype
期刊:
生物技术
ISSN:
1004-311X
年:
2017
卷:
27
期:
1
页码:
58-64+70
基金类别:
国家自然科学基金项目(“基于基因芯片技术的砂梨品种S基因型鉴定及S基因资源挖掘与进化分析” No.31272124)
机构署名:
本校为第一机构
院系归属:
林学院
摘要:
[目的]优化梨自交不亲和基因(S-RNase或S基因)c DNA芯片杂交条件,利用芯片检测梨品种S基因型。[方法]提取梨品种雌蕊RNA,Cy3标记引物RT-PCR获得S基因荧光标记特异c DNA序列。设置不同杂交条件,用已知S基因型品种荧光标记的PCR产物在不同条件下分别与芯片杂交,杂交信号分析芯片杂交效果。用芯片优化杂交体系鉴定梨品种未知S基因型,DNA测序验证芯片鉴定结果。[结果]芯片杂交最佳条件:杂交温度42℃,杂交时间8~9 h,PCR纯化产物终浓度为200 ng·μl-1。优化杂交条件下芯片鉴定晚咸丰、秀水、丽江马占梨1、湘菊、木通梨、甘甜、弥渡小红梨、丽江大中古、金晶和弥渡火把等梨品种S基因型分别为:Pp S...
摘要(英文):
[Objective]To optimize the hybridization condition of self-incompatibility gene(S-RNase or S gene) c DNA microarray and by the chip to identify S-genetypes of pear cultivars. [Methods]Total RNA was extracted from pear pistils,with which fluorescently-labeled specific c DNA sequences of S-RNase were amplified by RT-PCR amplification using Cy3-labeled specific primers. The hybridization effects of that the purified PCR products of pear cultivars with known S-genotype were hybridized with the c DNA microarray in different condition were analysed...

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