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杨树MIR169基因家族分子进化分析

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成果类型:
期刊论文
作者:
刘志祥;曾超珍;谭晓风
通讯作者:
Liu, Z.X.
作者机构:
[刘志祥] 中南林业科技大学生命科学与技术学院,长沙410004
[刘志祥] 中南林业科技大学林学院,长沙410004
[刘志祥] 经济林育种与栽培国家林业局重点实验室,长沙410004
中南林业科技大学生命科学与技术学院,长沙,410004
[曾超珍; 谭晓风] 中南林业科技大学
语种:
中文
关键词:
毛果杨;MIR169基因家族;分子进化
关键词(英文):
MIR169 gene family;molecular evolution
期刊:
遗传
ISSN:
0253-9772
年:
2013
卷:
35
期:
11
页码:
1307-1316
基金类别:
湖南省自然科学基金项目(编号:13JJ3095); 中南林业科技大学青年基金项目(编号:QJ2011042B)资助;
机构署名:
本校为第一机构
院系归属:
林学院
生命科学与技术学院
摘要:
MicroRNA(miRNA)是真核生物中普遍存在的一类参与基因表达调控的小分子RNA。ptc-MIR169基因家族有33个成员, 是杨树中规模最大的miRNA基因家族。研究MIR169基因家族的进化对揭示杨树miRNA基因的进化机制具有重要的意义。文章对毛果杨MIR169基因家族的分子系统发育、基因倍增模式、表达分化和靶基因进行了分析。结果表明, 染色体大片段重复和串联重复在毛果杨MIR169基因家族扩张中均具有重要作用; MIR169基因家族在表达方式上已经出现了较大的分化; MIR169基因家族可能在杨树中已经形成了复杂的调控网络, 对杨树的生长发育和适应性等具有重要的调控作用。文章为杨树及杨柳科相关植物中miRNA基因家...
摘要(英文):
MicroRNAs (miRNAs) are a class of short non-coding RNAs found widely in eukaryotic organisms. The ptc-MIR169 gene family, which consists of 33 members, is the largest miRNA gene family in poplar (Populus trichocarpa) It is significant to analyze the evolution of the ptc-MIR169 gene family in order to understand the evolutionary mechanisms of miRNAs in poplar. In the present study, we investigated the molecular phylogeny, duplication, expression and target genes of the MIR169 gene family in poplar. Both tandem duplications and chromosome segmental duplications contributed to the expanding of pt...

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