油茶分子育种是指按照人们的愿望，进行严密的设计，通过体外DNA重组技术和DNA转移技术，有目的地改造油茶的生物特性，以创造出新的品种类型的技术体系。油茶分子育种技术主要包括转基因育种和分子标记辅助选择育种。油茶分子标记辅助选择育种还处于分子标记开发阶段。转基因育种还处于前期的基础研究阶段，国内已经开展了油茶的EST、转录组、表达谱、基因注释、重要基因克隆及其功能研究，开展了部分重要基因对拟南芥、油菜等的转基因实验研究。油茶分子育种的主要目标是提高油茶种仁的含油率、改善茶油的品质、增强油茶的抗逆性能等方面。
