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适于转录组测序的枣不同器官总RNA提取方法筛选

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成果类型:
期刊论文
论文标题(英文):
Screening of total RNA extraction methods for RNA-sequences from different organs in Ziziphusjujuba
作者:
魏琦琦;冯延芝;林青;贾宝光;张琳
作者机构:
中南林业科技大学 经济林育种与栽培国家林业局重点实验室,湖南长沙 410004
中南林业科技大学 经济林培育与保护省部共建教育部重点实验室,湖南长沙 410004
中南林业科技大学 经济林培育与利用湖南省2011协同创新中心,湖南长沙 410004
中国林业科学研究院 经济林研究开发中心,河南 郑州,450003
[贾宝光; 林青; 张琳; 魏琦琦] 中南林业科技大学
语种:
中文
关键词:
中秋酥脆枣;转录组测序;RNA提取;RNA完整性
关键词(英文):
transcriptome sequencing;RNA extraction;RNA integrity
期刊:
经济林研究
ISSN:
1003-8981
年:
2015
卷:
33
期:
2
页码:
63-67
基金类别:
基金项目:国家“十二五”农村领域科技计划课题(2013BAD14803).
机构署名:
本校为第一机构
院系归属:
林学院
摘要:
为获得适用于转录组测序的枣花、结果枝和果实的总RNA提取方法,以中秋酥脆枣为材料,比较分析了Ambiogen和Autolab 2种总RNA提取试剂盒和基于Autolab试剂盒改良的CTAB法的总RNA的提取效果.结果表明:3种方法提取RNA的OD260/OD280差别不大,但用2种试剂盒提取的RNA有降解,其中Ambiogen试剂盒提取的花、结果枝和果实3个器官的RNA质量浓度分别为126、284和222 ng/μL;Autolab试剂盒提取的RNA质量浓度分别为307、402和266 ng/μL;基于Autolab试剂盒改良的CTAB法提取的RNA质量浓度分别为401、417和296 ng/μL.与2种试剂盒相比,基于Autolab试剂盒改良的CTAB法提取出来的RNA完整性好、纯度和浓度高,能够满...
摘要(英文):
In order to obtain the methods for high-quality total RNA extraction from flower, fruit bearing branch and fruit in Ziziphusjujuba, taking Z. jujuba cv. 'Zhongqiusucui' as materials, and the RNA extraction effects were compared using two kinds of total RNA extraction kits (Ambiogen and Autolab) and modified CTAB method based on the Autolab RNA extraction kit. The results showed that OD260/OD280 values of the RNA extracted by using the three RNA extraction methods had no significant differences, but a part of RNAs obtained by the two RNA ext...

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