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油茶CoUXS1基因全长cDNA克隆及生物信息学分析

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成果类型:
期刊论文
作者:
曾艳玲;谭晓风;王保明;龙洪旭;刘凯;...
作者机构:
[曾晓峰; 刘凯; 曾艳玲; 龙洪旭; 王保明; 谭晓风] 中南林业科技大学
语种:
中文
关键词:
油茶;系统进化分析;结构域功能预测
关键词(英文):
UXS;cDNA
期刊:
中国农学通报
ISSN:
1000-6850
年:
2012
卷:
28
期:
22
页码:
39-44
基金类别:
国家自然科学基金“油茶Accase基因的分离克隆及功能研究”(31070603); 国家“十一五”科技支撑计划“油茶可持续丰产栽培关键技术研究”(2009BADB1B02); 中南林业科技大学校青年基金项目“油茶果糖-1,6-二磷酸醛缩酶基因克隆及遗传转化研究”(QJ2011008A);
机构署名:
本校为第一机构
院系归属:
林学院
摘要:
为了揭示油茶UDP-葡萄糖醛酸脱羧酶基因的序列特点和结构功能,为该基因的深入研究和开发应用奠定基础。根据油茶种子EST文库中调取的UDP-葡萄糖醛酸脱羧酶基因序列,设计特异引物,利用RT-PCR技术获得该基因全长cDNA克隆,并对其序列进行生物信息学分析。结果表明:该基因阅读框为1032bp,编码344个氨基酸,具有典型的UXS家族模体序列。与海岛棉GhUXS3基因亲缘关系最近,定位于细胞质,有较强的亲水性,将该基因命名为CoUXS1,GenBank登录号为JN017094。
摘要(英文):
In order to reveal sequence features and structural function of the UDP-glucuronate decarboxylase gene in Camellia oleifera,and based for the further research,the specific primers were designed according to the UDP-glucuronate decarboxylase gene sequence from Camellia oleifera seed EST library.Using RT-PCR technology,the gene full-length cDNA clones were obtained.Then the sequence was analyzed by bioinformatic software.The results showed that:the ORF box included 1032 bp and encoded 344 amino acids.The sequence had typical UXS family motif seq...

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