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梨自交不亲和基因cDNA芯片制备及对部分砂梨品种S基因型的鉴定

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成果类型:
期刊论文
作者:
江南;谭晓风;张琳;张靖国;胡红菊
作者机构:
[江南] 湖南工业大学包装与材料工程学院
[谭晓风; 张琳] 中南林业科技大学
[张靖国; 胡红菊] 湖北省农业科学院果树茶叶研究所
语种:
中文
关键词:
梨;自交不亲和;S基因型;cDNA芯片;寡核苷酸芯片
关键词(英文):
c;self-incompatibility;S-genotype;c DNA microarray;oligonucleotide genechip
期刊:
园艺学报
ISSN:
0513-353X
年:
2015
卷:
42
期:
12
页码:
2341-2352
基金类别:
国家自然科学基金项目(31272124);
机构署名:
本校为其他机构
院系归属:
林学院
摘要:
利用东方梨中已鉴定的52个S等位基因HV区c DNA序列作为靶基因序列设计探针,制备梨S基因c DNA检测芯片,每张芯片上含有240个位点55个c DNA探针,包含所有序列完善的S基因HV区特异的c DNA序列。以被检测品种雌蕊c DNA为模板,采用Cy3荧光修饰引物经S基因特异PCR扩增标记被检测品种的c DNA序列,并与芯片杂交以检测不同品种的S基因型。结果表明:利用c DNA检测芯片与‘丽江黄酸梨’、‘秀玉’、‘弥渡玉梨’、‘白面梨’和‘德胜香’等已知S基因型品种杂交,杂交结果显示与S基因寡核苷酸芯片检测信号一致,与各品种已知S基因型相符合。利用c DNA芯片和进一步完善的S基因寡核苷酸芯片并行检测鉴定了‘文山...
摘要(英文):
Using the c DNA sequences from Hyper variable(HV)regions of 52 S-alleles in Oriental pear cultivars,c DNA microarray for S-RNase detections was established. Totally 240 dots and 55 c DNA probes,which includes all the HV specific c DNA sequences of perfected S-RNase gene,were spotted on the chip. By Cy3-labeled primers and c DNA template of tested cultivars pistils,the Cy3-labeled specific c DNA PCR products of S-RNase were amplified and hybridized with the c DNA microarray in order to detect the S genotype of pear cultivars. Cultivars with kn...

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