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基于基因组DNA混合池的EST-SSR引物快速筛选方法研究

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成果类型:
期刊论文、会议论文
作者:
刘果;谢耀坚;张党权;谷振军
作者机构:
[谢耀坚; 刘果] 国家林业局桉树研究开发中心
[谷振军; 张党权] 中南林业科技大学
语种:
中文
关键词:
基因组DNA混合池;引物筛选
关键词(英文):
EST-SSR, PCR
期刊:
中南林业科技大学学报
ISSN:
1673-923X
年:
2012
卷:
32
期:
9
页码:
124-129
会议名称:
第十届中国林业青年学术论坛
会议论文集名称:
第十届中国林业青年学术论坛论文集
会议时间:
2012-09-01
会议地点:
南京
会议赞助商:
中国林学会
基金类别:
201104003:林业公益性行业科研专项 2011AA100202:国家高技术研究发展计划(863计划) 2010NK2008,2011NK2019:湖南省科技厅重点项目 2011AA100203:国家高技术研究发展计划(863计划)
机构署名:
本校为第一机构
院系归属:
林学院
摘要:
林木SSR标记的引物筛选工作量大,十分费时且消耗大量实验材料。采用基因组DNA混合池技术,将研究对象的若干个基因组DNA样品等量混合后,作为单一模板进行SSR的PCR扩增,能显著降低实验的工作量和成本。以选择的150对EST-SSR引物为对象,对6个桉树基因组DNA样品进行等量混合,进行PCR扩增筛选引物,结果表明,与常规筛选方法相比,基因组DNA混合池方法大幅度缩短了实验周期,显著减少了基因组DNA的消耗,可用于大量林木SSR引物的快速高效筛选。
摘要(英文):
The screening of SSR primers for forestry is a heavy research which is very time consuming and consume intensive experimental materials.By employing genomic DNA pooling technology,a method of mixing several genomic DNA templates equivalently as the single template for PCR,was used to quickly screen SSR primers,which will significantly reduce the experimental workload and cost.Genomic DNA pooling constructed by equivalently mixing 6 Eucalyptus genomic DNA templates was used to screen 150 pairs of EST-SSR primers.The analytical results show that comparing with conventional screening method,the g...

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