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桉树ISSR-PCR反应体系的建立及优化

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成果类型:
期刊论文
作者:
曾艳玲;谢鹏;谢耀坚;谭晓风
作者机构:
[谢耀坚; 曾艳玲; 谭晓风; 谢鹏] 中南林业科技大学
语种:
中文
关键词:
分子生物学;桉树;叶片基因组DNA;优化
关键词(英文):
ISSR-PCR
期刊:
中南林业科技大学学报
ISSN:
1673-923X
年:
2008
卷:
28
期:
1
页码:
44-48
基金类别:
长沙市科技计划重点项目(K069083-22)部分研究内容;
机构署名:
本校为第一机构
院系归属:
林学院
摘要:
模板DNA、引物、dNTPs、Mg~(2+)的浓度,Taq DNA聚合酶的用量以及退火温度是影响简单序列重复区间扩增(ISSR-PCR)结果的主要因素.以桉树叶片基因组DNA为试材,系统地测试了这6个因素对桉树ISSR反应结果的影响.结果表明;最优化的反应体系即20μL反应体系中,含20 ng模板DNA、0.4 μmol·L~(-1)随机引物、0.15 mmol·L~(-1) dNTPs,2.0 mmol·L~(-1)Mg~(2+)、1.25 U Taq DNA聚合酶.最佳退火温度为55℃;PCR反应程序为94 ℃预变性5 min; 94 C变性45 s,55 ℃退火45 s,72℃延伸1.5 min,35个循环;72℃再延伸7 min.
摘要(英文):
Template DNA, primers, dNTPs, Mg^2+ concentration, dose of Taq DNA polymerase and annealing temperature are primary factors to ISSR-PCR. With the genomic DNA of Eucalyptus leaves as material, the six factors were systematically analyzed. The result shows that the optimal reaction system of ISSR is the 20μL system containing 20 ng template DNA, 0.4 μmol· L^-1 random primers, 0. 15 mmol· L^-1 dNTPs, 2. 0 mmol·L^-1Mg^2+, and 1. 25 U Taq DNA polymerase; and that the optimized annealing temperature is 55℃, the PCR procedure is : pre-denatur...

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