油桐种胚再生体系的建立
作者:
李泽;谭晓风;张琳;龙洪旭;袁军;...
期刊:
经济林研究 ,2012年30(4):119-122 ISSN:1003-8981
作者机构:
中南林业科技大学经济林培育与保护教育部重点实验室,湖南长沙,410004;[李泽; 范晓明; 曾艳玲; 龙洪旭; 袁军; 张琳; 谭晓风] 中南林业科技大学
关键词:
油桐;种胚;再生体系;成苗率
摘要:
为了建立快速有效的油桐再生体系,以“葡萄桐”种胚为试材,研究了贮藏方式、消毒时间、培养基及培养条件对油桐种胚成苗的影响.结果表明:种子沙藏与在自然条件下贮藏对油桐种胚成苗的影响无明显差异;种胚的最佳消毒处理为0.1%的升汞浸泡3 min;将种胚接种在1/2MS+IAA 0.5 mg/L的培养基中成苗率最高,为98%;在培养基中加入6-BA易使种胚产生大量的愈伤组织,不利于油桐胚再生体系的建立;培养基的最适pH值为5.5;与遮光处理相比,光照能缩短种胚再生体系建立的周期.
语种:
中文
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Full-length DNA Cloning and Bioinformatic Analysis of Camellia oleifera Seed Ripening-Regulated Protein
作者:
Bao Meirong* ;Tan Xiaofeng;Tan, Wuyun
作者机构:
[Tan Xiaofeng; Bao Meirong; Tan, Wuyun] Cent South Univ Forestry & Technol, Key Lab Nonwood Forest Prod State Forestry Adm, Changsha, Hunan, Peoples R China.
会议名称:
International Symposium on Biomedicine and Engineering (ISBE 2011)
会议时间:
AUG 04-05, 2011
会议地点:
Bali Island, INDONESIA
会议主办单位:
[Bao Meirong;Tan Xiaofeng;Tan, Wuyun] Cent South Univ Forestry & Technol, Key Lab Nonwood Forest Prod State Forestry Adm, Changsha, Hunan, Peoples R China.
关键词:
Camellia oleifera;seed;cDNA library;ripening regulated protein;bioinformatics
摘要:
Based on the cDNA library and EST library of Camellia oleifera, the full-length DNA 1105 bp of Camellia oleifera Seed Ripening-Regulated Protein was isolated. The gene contains an intron with length of 139 bp, the cDNA length is 966 bp(GenBank Accession Number: FJ713027), and the coding sequence (CDS) is 702bp.The putative protein by the CDS consists of 233 amino acids with molecular weight of 25267.46 Da, and has the isoelectric point of 4.43, it is a half-membrane structure and non-secretory protein. This protein is similar with the ripening-regulated proteins of Lycopersicon esculentum and Solanum tuberosum by D-segment "DDDDDDDVD" and E-segment "EETEEB" through bioinformatic analysis, revealing that the conserved area rich in acidic amino acids including Asp, Glu and Ser is the functional region of this ripening-regulated protein in Camellia oleifera seed.
语种:
中文
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钛离子注入对油茶种子生理生化反应及初期生长的影响
作者:
曾艳玲;谭晓风;张斌;范晓明;刘长虹
期刊:
中国农学通报 ,2011年27(28):53-57 ISSN:1000-6850
作者机构:
[曾艳玲; 谭晓风; 张斌; 范晓明; 刘长虹] 中南林业科技大学林学院
关键词:
油茶;离子注入;生理生化反应
摘要:
为了开辟离子束生物技术在油茶育种研究方面的新途径,采用不同剂量的钛离子注入油茶种子,研究钛离子注入之后油茶种子体内过氧化物酶(POD)、超氧化物歧化酶(SOD)、电解质外渗率的变化,跟踪观察处理油茶种子播种之后的生长状况。结果表明,钛离子注入剂量在6×10~(16)~12×10~(16)Ti~(2+)/cm~2之间时,POD和SOD活性达到峰值,此时电解质外渗率最低。未出芽油茶种子较出芽油茶种子耐受能力更强,受钛离子注入负面影响相对较小。播种结果显示,注入剂量低于12×10~(16)Ti~(2+)/cm~2时,处理油茶种子成活率基本能得到保障,在中等剂量作用下还有促进生长的作用。
语种:
中文
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中国梨新SFBB-gamma基因的鉴定及序列分析
作者:
乌云塔娜;李洪果;包梅荣;谭晓风
作者机构:
[乌云塔娜; 李洪果; 包梅荣; 谭晓风] 中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业局重点实验室;[乌云塔娜; 李洪果; 包梅荣; 谭晓风] 中南林业科技大学林学院
会议名称:
第六届全国梨科研、生产与产业化论坛会
会议时间:
2011-11-01
会议地点:
保定
会议论文集名称:
第六届全国梨科研、生产与产业化论坛会论文集
关键词:
中国梨;自交不亲和性;SFBB基因
摘要:
分离鉴定了鸭梨、红皮酥、中梨二号和兰州软儿4个梨品种的SFBB-gamma基因,并对其序列进行了生物信息学分析。SFBB-gamma基因的特异性引物对4个梨品种进行PCR扩增结果表明,4个品种均扩增出一条1250bp左右的条带;通过DNA测序和生物信息学分析方法从4个梨品种中分离鉴定了SFBB21(EU422961)、SFBB26(EU422961)、SFBB31(EU422959)、SFBBd-
语种:
中文
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基于PCA和ICA的糖基化位点的预测和分析
作者:
王楚正;谭晓风;陈延伟
期刊:
计算机与应用化学 ,2011年28(5):565-568 ISSN:1001-4160
作者机构:
[王楚正] 中南林业科技大学计算机与信息工程学院;[谭晓风] 中南林业科技大学林学院;[陈延伟] 立命馆大学信息工程学院
关键词:
糖基化位点;主成分分析;独立成分分析;位置概率函数
摘要:
为了提高糖基化位点的识别率,提出主成分分析(PCA)和独立成分分析(ICA)相结合的新方法对O-糖基化位点进行预测和分析。以窗口长度为51的蛋白质序列为研究对象,采用稀疏编码方案,首先利用PCA算法对蛋白质序列进行去相关预处理,以降低原始蛋白质序列的维数。然后利用ICA算法进行训练,提取特征向量构建子空间。测试序列投影到每一类子空间,计算测试序列和每类子空间重构序列的距离,根据距离大小确定所属的类。实验表明,提出的新方法有较高的预测性能。
语种:
中文
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银杏叶绿素结合蛋白基因表达、全长cDNA克隆及分析
作者:
王义强;谭晓风;邢伟一;王启叶
作者机构:
中南林业科技大学生命科学与技术学院,长沙410004;中南林业科技大学经济林栽培育种国家林业局重点实验室,长沙410004;中南林业科技大学生物环境科学与技术研究所,长沙410004
会议名称:
全国第十九次银杏学术研讨会
会议时间:
2011-09-21
会议地点:
浙江长兴
会议论文集名称:
全国第十九次银杏学术研讨会论文集
关键词:
银杏;光合作用;叶绿素结合蛋白基因;基因克隆;分子机理
摘要:
为了从分子水平研究银杏光合作用的机理,采用EST文库方法,揭示了银杏叶绿素结合蛋白基因cab表达规律.同时,通过对所测EST序列拼接组装,从银杏中分离了叶绿素结合蛋白cab家族的一个基因,命名为GbCab1.GbCab1基因的cDNA序列全长为904 bp,含有一个完整的编码序列CDS(Coding sequence),CDS长度为813 bp(72~884bp),编码271个氨基酸.序列分析结果表明,GbCab1基因是光系统Ⅱ的一个捕光叶绿素结合蛋白基因,与禾本科植物玉米(Zea mays)捕光叶绿素a/b结合蛋白基因cab-m7有较高的同源性,相似性达到85%.系统进化树分析表明,GbCab1基因与银杏(Ginkgo biloba)PSⅡcab基因、樟子松(Pinus sylvestris cab)基因及西加云杉(Picea sitchensis cab)基因亲缘关系较近;PSⅡ叶绿素结合蛋白基因cab从原始裸子植物向裸子针叶树、单子叶植物方向进化,与物种进化树规律相似.另外,发现在银杏叶光反应相关基因中,Gb Cab1表达最为丰富,共获得18克隆子.
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中文
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油茶亲环素基因的鉴定与其在大肠杆菌中的表达
作者:
王保明;谭晓风
期刊:
中南林业科技大学学报 ,2011年31(10):85-93 ISSN:1673-923X
作者机构:
[王保明; 谭晓风] 中南林业科技大学
关键词:
油茶;亲环素基因;全长cDNA;克隆;原核表达
摘要:
利用构建的油茶近成熟种子cDNA文库,分离鉴定了一条油茶亲环素基因的cDNA序列;该序列全长975 bp(base pair),含有一个621 bp的开放码框,编码207个氨基酸,将其命名为co-cyp(GenBank登录号:FJ377540).该基因与其它物种的亲环素基因具有较高的同源性,结构分析表明该蛋白的二级结构以片层为主,并伴有α-螺旋、β转角和大量的无规则卷曲;其N端有一个强疏水性的信号肽序列,具有跨膜结构和较好的柔性;还具有N-连接糖基化位点、蛋白激酶C磷酸化位点、酪氨酸激酶Ⅱ磷酸化位点、酪氨酸激酶磷酸化位点、N-连接肉豆蔻酰位点、脯氨酸顺反异构酶标志序列、环孢菌素(CsA)结合位点(Trp)以及植物亲环素基因特有的7个氨基酸特征序列KSGKPLH.该蛋白属于亲环素B族,为球状分泌蛋白.在获得油茶亲环素基因全长cDNA的基础上,构建了该基因的原核表达重组子pET30b-CyP,在大肠杆菌BL21(DE3)中诱导表达,获得了约21 kDa的油茶亲环素蛋白.本研究对揭示油茶种子的油脂合成和抗逆性能等生物学规律具有重要意义.
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中文
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基于EST银杏光合作用相关基因表达分析
作者:
王义强;何方;谭晓风;孙吉康;邢伟一;...
期刊:
中南林业科技大学学报 ,2011年31(3):54-59 ISSN:1673-923X
作者机构:
[王义强] 中南林业科技大学生命科学与技术学院,湖南长沙410004;[王义强] 中南林业科技大学经济林栽培育种国家林业局重点实验室,湖南长沙410004;[王义强] 中南林业科技大学生物环境科学与技术研究所,湖南长沙410004;中南林业科技大学经济林栽培育种国家林业局重点实验室,湖南长沙,410004;中南林业科技大学生命科学与技术学院,湖南长沙,410004
关键词:
银杏叶;光合作用;EST文库;基因表达
摘要:
以银杏雌树成熟叶为材料构建cDNA文库,随机挑取2 324个克隆进行5′端测序,并将所得序列与核酸数据库进行同源性比较.结果显示:银杏叶光合作用基因ESTs为97条,占能量代谢相关的基因ESTs总数的75%;与光反应相关的基因主要有PSII捕光叶绿素a/b结合蛋白,放氧复合体蛋白,质体蓝素(PC),PSI捕光叶绿素a/b结合蛋白,PSI反应中心亚单位,铁硫蛋白,铁氧蛋白酶,ATP合成酶等;与暗反应相关的基因主要有核酮糖二磷酸羧化酶/加氧酶(RuBisCO),核酮糖二磷酸羧化酶/加氧酶激酶RuBisCO activase(RA),甘油醛--3--磷酸脱氢酶,核桐糖--5--磷酸异构酶,丙糖磷酸异构酶等;RuBisCO基因表达相当丰富,与落叶松Larix laricinaRuBisCO同源.这些结果为揭示银杏光合作用过程中的基因表达和生理过程提供了科学依据
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中文
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梨4个SFBB~(-γ)基因的分离及遗传多态性分析
作者:
乌云塔娜;李洪果;李振国;包梅荣;谭晓风
期刊:
林业科学 ,2010年46(1):147-151 ISSN:1001-7488
作者机构:
[包梅荣; 乌云塔娜; 谭晓风; 李洪果] 中南林业科技大学;[李振国] 内蒙古克什克腾旗林业局黄冈梁林场
关键词:
梨属;自交不亲和性;SFBB~(-γ)基因
摘要:
茄科(Solanaceae)、芸苔属(Brassica)、蔷薇科(Rosaceae)植物多数属于配子体自交不亲和型,即雌蕊和花粉自交不亲和基因的产物相互作用而控制自交亲和性的发生.20世纪90年代分离鉴定了雌蕊自交不亲和基因及编码产物(Tao et al.,1997;Ushijima et al.,1998),而近几年才分离鉴定花粉自交不亲和基因,配子体自交不亲和植物的花粉自交不亲和基因具有F-box基因的特点.
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中文
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基于PCA和BP神经网络的O--糖基化位点的预测和模式分析
作者:
王楚正;谭晓风;陈延伟;何伟
期刊:
中南林业科技大学学报 ,2010年30(9):61-65,75 ISSN:1673-923X
作者机构:
[王楚正; 何伟] 中南林业科技大学计算机与信息工程学院;[谭晓风] 中南林业科技大学林学院;[陈延伟] 立命馆大学信息工程学院
关键词:
O—糖基化;模式分析;主成分分析;BP神经网络
摘要:
糖基化是真核细胞中最常见的翻译后蛋白质修饰过程之一。传统的神经网络方法已被应用预测蛋白质糖基化位点,预测的准确性主要依赖于特征向量的维数(蛋白质序列的长度),并随着蛋白质序列长度的增加而提高,但网络的结构变得越来越复杂,增加了计算运行成本。为了解决这一问题,提出了主成分分析和BP神经网络相结合的新方法对O—糖基化位点进行预测和分析,用PCA提取主成分构造子空间以降低输入的蛋白质序列的维数,再用BP神经网络预测一个特定的蛋白质序列是否被糖基化。实验表明,提出的新方法能大大缩短计算时间,并能提高预测的准确性。
语种:
中文
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油茶种子总RNA提取及Cod8FAD基因的鉴定
作者:
胡姣;谭晓风;张琳;龙洪旭
期刊:
浙江林业科技 ,2010年30(2):17-21 ISSN:1001-3776
作者机构:
中南林业科技大学林学院经济林育种与栽培国家林业局重点实验室,湖南,长沙,410004
关键词:
油茶;RNA提取;改良CTAB法
摘要:
油茶种子胚乳中富含脂肪、多糖和酚类公合物,要获得高质量的RNA难度较大。本研究以油茶优良无性系湘林1号近成熟种子的胚乳为实验材料,在试剂盒的基础上应用改良的CTAB法提取总RNA。结果表明,使用改良后的CTAB法配合试剂盒提取RNA操作简单,且能够有效去除油茶种子中多糖和多酚类等次生物质,从而得到高质量的RNA。以获得的RNA为模板,设计简并引物,通过RT-PCR,成功从油茶种子中鉴定出了油脂合成的关键酶基因之一△8脂肪酸脱饱和酶基因,命名为Cod8FAD(Camellia oleifera delta 8 fatty acid desaturase),该基因与茶树△8脂肪酸脱饱和酶基因相似性最高,为97%,与耧斗菜△8脂肪酸脱饱和酶基因相似性最低,为62%。
语种:
中文
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Identification of a novel S-RNase gene and S-genotypes of four pear (Pyrus pyrifolia) cultivars
作者:
Zhang Lin* ;Hu Jiao;Tan Xiaofeng;Long Hongxu;Yuan Deyi;...
作者机构:
[Tan Xiaofeng; Long Hongxu; Yuan Deyi; Zhang Lin; Hu Jiao] Cent South Univ Forestry & Technol, Coll Forestry, Forestry Minist, Key Lab Nonwood Forest Prod, Changsha 410004, Hunan, Peoples R China.;[Li Xiugen] Chinese Acad Agr Sci, Zhengzhou Fruit Res Inst, Zhengzhou 450009, Peoples R China.
会议名称:
4th International Conference on Bioinformatics and Biomedical Engineering (iCBBE)
会议时间:
JUN 18-20, 2010
会议地点:
Chengdu, PEOPLES R CHINA
会议主办单位:
[Zhang Lin;Hu Jiao;Tan Xiaofeng;Long Hongxu;Yuan Deyi] Cent South Univ Forestry & Technol, Coll Forestry, Forestry Minist, Key Lab Nonwood Forest Prod, Changsha 410004, Hunan, Peoples R China.^[Li Xiugen] Chinese Acad Agr Sci, Zhengzhou Fruit Res Inst, Zhengzhou 450009, Peoples R China.
会议论文集名称:
International Conference on Bioinformatics and Biomedical Engineering
关键词:
Pyrus pyrifolia;gametophytic self-incompatibility (GSI);S-genotype;S-RNase;bioinformatics
摘要:
Gametophytic self-incompatibility (GSI) is a genetically controlled mechanism to prevent inbreeding and promote out-crossing. Pyrus pyrifolia is a commercially important fruit tree that exhibits GSI. It is necessary to identify S-genotypes of cultivars for determination of cross-compatible combination prior to performing pear plantation and breeding programs. In this study, an important local cultivar `Huobali' extensively used as parent in pear breeding programs, and its three progenies `Mantianhong', `Hongsucui' and `Meirensu' were used for S-genotyping analysis by PCR-based molecular method. Agarose gel electrophoresis showed that two fragments were produced in each of the three progenies, while three in the `Huobali'. After restriction digestion and sequencing analysis, the S-alleles in the four cultivars were determined. The allele of 345 bp from `Huobali' was determined as a novel S-RNase allele that was tentatively denominated as S-44-RNase. RT-PCR revealed that the S-44-RNase was expressed specifically in the styles, which is consistent with the expression pattern of S-RNases. Comparison of genomic and cDNA sequences revealed an intron of 148 bp for the S-44-RNase. At the amino acid level, it shared 65% to 93% similarity with other Maloideae S-RNases. This study will be helpful in pear production and breeding programs.
语种:
英文
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Co-rrp基因小干扰RNA载体的构建及烟草中的遗传转化
作者:
包梅荣;谭晓风;乌云塔娜;张琳
期刊:
中南林业科技大学学报 ,2010年30(10):68-71,77 ISSN:1673-923X
作者机构:
[包梅荣; 乌云塔娜; 张琳; 谭晓风] 中南林业科技大学
关键词:
油茶;种子;成熟调控蛋白基因;植物表达载体;小干扰RNA;转基因烟草
摘要:
为研究油茶种子成熟调控蛋白基因的功能,以pCAMBIA1304质粒为载体,根据油茶种子成熟调控蛋白基因的cDNA序列设计了小干扰RNA(Si RNA)序列,构建了油茶种子成熟调控蛋白基因小干扰RNA植物表达载体pCAMBIA1304-si RNA,并借助农杆菌介导叶盘法将pCAMBIA1304-si RNA转化到野生型烟草中,获得了稳定表达的转基因烟草苗。为下一步的油茶种子成熟调控蛋白基因的功能鉴定奠定了基础。
语种:
中文
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油茶14-3-3蛋白基因的cDNA克隆及序列分析
作者:
刘巧;谭晓风;胡孝义;田晓明
期刊:
江西农业大学学报 ,2010年32(3):541-546 ISSN:1000-2286
作者机构:
[胡孝义; 刘巧; 田晓明; 谭晓风] 中南林业科技大学
关键词:
油茶;14-3-3蛋白;基因克隆;序列分析;结构预测
摘要:
以构建的油茶近成熟种子cDNA文库和EST文库为基础,采用分子克隆技术,分离克隆1个14-3-3蛋白的全长cDNA序列,由1 156个核苷酸组成,5’非编码区57 bp,3’非编码区301 bp,开放阅读框长777 bp,编码259个氨基酸。该基因编码蛋白的分子质量为29.466 ku,等电点4.78,无信号肽序列,是非分泌蛋白,命名为Co-14-3-3a。推测的二级结构有9个α-螺旋,1个反平行的β-折叠,位于αC和αD之间。
语种:
中文
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不同套袋处理对甜柿果实品质的影响
作者:
胡青素;谭晓风;龚榜初
期刊:
林业科学研究 ,2010年23(2):209-214 ISSN:1001-1498
通讯作者:
Hu, Q.-S.
作者机构:
[龚榜初] Research Institute of Subtropical Forestry, Chinese Academy of Forestry, Fuyang 311400, Zhejiang, China;[谭晓风] Forest College, Central South University of Forest and Technology, Changsha 410006, Hu'nan, China;[胡青素] Research Institute of Subtropical Forestry, Chinese Academy of Forestry, Fuyang 311400, Zhejiang, China, Forest College, Central South University of Forest and Technology, Changsha 410006, Hu'nan, China
通讯机构:
[Hu, Q.-S.] R;Research Institute of Subtropical Forestry, Chinese Academy of Forestry, China
关键词:
套袋;'富有'甜柿;色素;色泽;内外品质
摘要:
为探讨套袋对甜柿果实品质的影响,采用9种果袋,于7月10日统一对'富有'甜柿果实进行套袋试验,10月7日去袋,至11月7日果实成熟时统一采摘.研究结果表明:采前30 d去袋的套袋处理利于甜柿果实着色,双层袋处理5使果实呈典型的橙黄色.果皮中色素与色泽呈显著相关性.单层袋处理7极显著降低了果面锈斑率及病褐斑发生率.套袋降低了甜柿果实内可溶性固形物和还原糖含量,以双层袋的降低效应较为明显.单层袋及双层袋处理6显著提高了果实内可溶性总糖和维生素C含量.各果袋均利于提高甜柿果实内游离氨基酸和蛋白质含量,单层袋处理7使果实内蛋白质的含量达到6.1×10~(-3) mg·g~(-1),达到显著差异水平.双层袋处理6除对Zn的含量有降低外, 均明显提高其它各类矿质元素的含量.综合考虑各项指标得出,白色复合纸单层袋最适于提高甜柿果实的内外品质,外黄内白双层袋次之.
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湖南桂阳马尾松种子园遗传多样性的ISSR分析
作者:
杨玉洁;张冬林;杨模华;李志辉;唐效蓉;...
期刊:
中南林业科技大学学报 ,2010年30(3):85-89 ISSN:1673-923X
作者机构:
[杨玉洁; 张冬林; 杨模华; 李志辉] 中南林业科技大学林学院;[唐效蓉] 湖南省林业科学院;[丁贵杰] 贵州大学林学院;[谭晓风] 中南林业科技大学
关键词:
森林培育学;马尾松;种子园;遗传多样性
摘要:
本研究从100条ISSR引物中筛选出11条多态性引物,对湖南桂阳马尾松第二代种子园共87份样品进行遗传多样性分析,共扩增得到246个多态位点.采用PAUP4.0软件分析,获得两个主要群体(广西群体和城步群体),在城步群体内,湖南和贵州两省的家系被分开.再对两个主要群体采用POPGEN32软件分析,结果表明:在桂阳第二代种子园内总的多态位点百分率达98.80%,总的Shannon信息指数为0.583 7,Nei's基因多样性指数为0.400 3,2个群体的多态位点百分率分别为93.57%、98.80%,各群体间的基因分化系数为0.036 3,基因流为13.258 6.这表明桂阳第二代马尾松种子园的遗传多样性水平高,个体间的基因多样性变异大,该种子园所采用的建园方式是可取的.
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柿子的应用价值及发展前景
作者:
胡青素;龚榜初;谭晓风;李大伟
期刊:
湖南农业科学 ,2010年(1):103-106 ISSN:1006-060X
作者机构:
[胡青素; 龚榜初; 李大伟] 中国林业科学院亚热带林业研究所;[谭晓风] 中南林业科技大学林学院
关键词:
柿子;分类;应用价值;发展前景
摘要:
柿子在我国已有3 000多年的栽培历史,适应性强,分布广泛.园艺界将柿的品种一般分为4个类群.柿子不仅营养丰富.含有大量的糖类及多种维生素营养物质.而且具有很高的药用价值和经济价值,是山区脱贫致富的重要经济树种.为了促进柿子产业的发展,特别介绍了柿子各组成部分的主要利用价值及其开发应用鲋景,并对柿子的贮藏保鲜技术作了阐述和展望.
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湖南城步马尾松种子园遗传多样性的ISSR研究
作者:
张冬林;杨玉洁;杨模华;李志辉;唐效蓉;...
期刊:
中南林业科技大学学报 ,2010年30(12):6-10 ISSN:1673-923X
作者机构:
[张冬林; 杨玉洁; 杨模华; 李志辉] 中南林业科技大学林学院;[唐效蓉] 湖南省林业科学院;[丁贵杰] 贵州大学林学院;[谭晓风] 中南林业科技大学
关键词:
马尾松;种子园;遗传多样性
摘要:
利用ISSR分子标记技术,对湖南城步马尾松种子园的4个种源区的11 7个无性系的马尾松遗传多样性进行了研究.采用了10个ISSR引物扩增共获得了218个标记位点,其中有210个为多态位点,多态位点比率为 96.33%.不同种源区多态位点百分率在88.99%~90.37%之间.其中两广种源区的多态位点百分率最高,达 90.37%,说明其种源内遗传变异水平在4个种源区中是最高的.总的Shannon多样性指数为0.503 0.Nei,s遗传多样性指数为0.334 7.各个种源区的遗传一致度的变化范围在0.968 9~0.981 2之间,各群体间的基因分化系数为0.039 3,基因流为12.221 904个种源区间Nei's遗传距离UPGMA聚类分析结果表明,遗传距离 (0.0190)最小的为雪峰山地种源区与贵州种源区首先聚类,雪峰山地种源区、贵州种源区与南岭山脉种源区依次聚类,遗传距离最大(0.031 6)的是两广种源区与贵州种源区,两广种源区在遗传距离上与其他3个种源区的聚类相距较远,这与其地理分布格局大致吻合.本研究的初步结果为无性系种子园的经营和择伐提供了一定的理论依据
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油茶乙酰辅酶A羧化酶BC亚基全长cDNA克隆及序列分析
作者:
谭晓风;蒋瑶;王保明;张琳
期刊:
中南林业科技大学学报 ,2010年30(2):1-9 ISSN:1673-923X
作者机构:
[蒋瑶; 王保明; 张琳; 谭晓风] 中南林业科技大学
关键词:
油茶;乙酰辅酶A羧化酶;基因克隆;序列分析
摘要:
以油茶'湘林1号'品种的近成熟种子为材料,采用简并PCR、RACE、交错PCR等技术,获得了油茶乙酰辅酶A羧化酶BC亚基基因的全长cDNA克隆.该基因cDNA序列全长1 901 bp,含有一个1 599 bp的ORF,编码533个氨基酸残基.BC蛋白的等电点pI为6.88,分子量为58 509.3 U,含两个跨膜结构域,是一个不稳定的非分泌蛋白.模体搜索结果表明在BC上具有N-糖基化位点、蛋白激酶C磷酸化位点、ATP结合位点等多个功能结构域.同源建模的模型中发现12个α-螺旋,整个BC蛋白为一个内凹的结构,该基因已登录到GenBank,并被命名为CO-bc.
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基于ISSR分子标记的桉树遗传分析
作者:
曾艳玲;谭晓风;张党权;谢鹏;曾晓峰
期刊:
种子 ,2010年29(1):24-27 ISSN:1001-4705
作者机构:
[曾艳玲; 谭晓风; 张党权; 谢鹏; 曾晓峰] 中南林业科技大学林学院,经济林育种与栽培国家林业局重点实验室
会议名称:
第二届中国林业学术大会——S9 木本粮油产业化
会议时间:
2009-11-07
会议地点:
中国广西南宁
关键词:
桉树;聚类分析;亲缘关系
摘要:
采用ISSR分子标记技术对5个按树原种和3个推广的杂交桉树品种进行基因组DNA多态性分析.从100条引物中筛选出10条用于ISSR-PCR扩增,共扩增出155务DNA条带,其中多态性条带148条,占总条带数的95.5%.通过NTSYSpc2.10e软件分析ISSR扩增结果,结果表明,桉树资源具有较丰富的遗传多样性,8份桉树材料的遗传距离(GD)值范围为0.4195~1.003 4,遗传相似性(SM)值范围为0.4200~0.693 3.应用UPGMA法进行聚类分析,将8份桉树材料划分为3个大类,邓恩桉和赤桉为一类;巨尾桉、尾巨桉、尾细桉、韦塔桉、粗皮按为一类;托里桉则独成一类.
语种:
中文
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